La paroisse de Malagnou est créée en 1951 et des cultes dominicaux sont célébrés dès 1953 dans une villa, sise au 2 chemin de Rieu. En 1956, elle est détachée de la paroisse des Eaux-Vives. En 1958, les architectes Michel et Gilbert Frey remportent le concours pour la création du centre paroissial et du temple qui seront construits seulement en 1970-1971 par Michel Frey et Gérard Varesio. Le sanctuaire se caractérise par des murs de briques apparentes. Six vitraux en dalle de verre sont imaginés par Bodjol. En 1976, un auvent est ajouté (BRULHART-DEUBER-PAULI (1985) 1993).
Armand Brulhart et Erica Deuber-Pauli, “Route de Malagnou”, in Ville et canton de Genève, coll. “Arts et monuments”, SHAS, Berne, (1ère éd. 1985) 1993, p. 169
Paroisse de Champel-Malagnou (2015). Centres paroissiaux. Récupéré le 2 juin 2015 du site de l’Eglise protestante de Genève : http://epg.ch