Der Kirchensatz von Moosseedorf gehörte von 1256 bis zur Reformation im Jahr 1528 dem Johanniterhaus in Münchenbuchsee. Im Reformationsjahr 1528 gelangte er an Bern.
Das romanische Schiff der Kirche erhielt um 1520/25 unter Peter von Englisberg (1470–1545), dem letzten Vorsteher (1508–1528/29) der Johanniterkomturei Buchsee, den heutigen Polygonalchor. Gleichzeitig wurden im Langhaus Masswerkfenster ausgebrochen. 1873/74 erfolgte ein tiefgreifender historisierender Umbau. Zu weiteren Restaurierungen kam es 1915/16, 1965/66 (Wiederherstellung des spätgotischen Zustands) und 2003 (u.a. Fensterrenovation).

Andrea Zellweger, Kirche Moosseedorf. Kanton Bern (Schweiz. Kunstführer), Bern 2005.